MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	A	6	6	1372	1377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013157	TATT	2	8	1387	1394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013157	A	7	7	1440	1446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013157	TA	3	6	1447	1452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013157	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013157	A	6	6	1473	1478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013157	CACC	2	8	3822	3829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_013157	ACC	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013157	A	6	6	4682	4687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013157	A	6	6	4695	4700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013157	A	6	6	4721	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013157	ACC	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013157	A	7	7	6695	6701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013157	A	8	8	9260	9267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013157	AGG	2	6	9320	9325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013157	AGT	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013157	T	6	6	9404	9409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013157	TA	3	6	9429	9434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013157	TA	3	6	9441	9446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013157	TAA	2	6	9466	9471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013157	A	7	7	9470	9476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013157	CCCCA	2	10	9691	9700	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
23	NC_013157	ACC	2	6	10516	10521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013157	A	7	7	10546	10552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013157	T	7	7	10910	10916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013157	ACC	2	6	11041	11046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013157	T	6	6	11345	11350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013157	A	7	7	11358	11364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013157	TGG	2	6	11369	11374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013157	T	8	8	11925	11932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013157	TGG	2	6	11947	11952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013157	C	6	6	11964	11969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_013157	T	6	6	12159	12164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013157	T	7	7	12167	12173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013157	CAT	2	6	12188	12193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013157	CT	3	6	12430	12435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013157	AATA	2	8	12446	12453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013157	TAT	2	6	12476	12481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013157	A	7	7	12484	12490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013157	TGG	2	6	12501	12506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013157	CCCA	2	8	12524	12531	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_013157	GGT	2	6	12569	12574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013157	GAT	2	6	12605	12610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013157	AT	3	6	12609	12614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013157	ATA	2	6	12625	12630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013157	TA	3	6	12632	12637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013157	ATAA	2	8	12653	12660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013157	TCA	2	6	12666	12671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013157	CATAGA	2	12	12680	12691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013157	TATTTT	2	12	12980	12991	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013157	T	6	6	13009	13014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013157	AAT	2	6	13051	13056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013157	T	6	6	13075	13080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013157	TTAT	2	8	13102	13109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013157	CCG	2	6	13127	13132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013157	A	6	6	13137	13142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013157	TTAT	2	8	13189	13196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013157	ATT	2	6	13225	13230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013157	TTATC	2	10	13231	13240	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013157	TTAAAA	2	12	13244	13255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013157	TAA	2	6	13256	13261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013157	AAAATT	2	12	13273	13284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013157	TTAT	2	8	13298	13305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013157	GATATC	2	12	13316	13327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013157	TTA	2	6	13351	13356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013157	T	6	6	13381	13386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013157	CTT	2	6	13395	13400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013157	TA	3	6	13419	13424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013157	GAT	2	6	13430	13435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013157	ATC	2	6	13446	13451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013157	TAT	2	6	13465	13470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013157	CAA	2	6	13478	13483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013157	A	6	6	13489	13494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013157	G	6	6	13496	13501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013157	GCAG	2	8	13548	13555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013157	AAAT	2	8	13560	13567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013157	ATC	2	6	13607	13612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013157	AT	3	6	13624	13629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013157	TGA	2	6	15768	15773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013157	A	7	7	17173	17179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013157	AAG	2	6	17189	17194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013157	ATT	3	9	17246	17254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013157	ATT	2	6	17405	17410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013157	AATA	2	8	17724	17731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013157	T	6	6	18203	18208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013157	TA	4	8	18255	18262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013157	ATT	2	6	18338	18343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013157	T	6	6	18869	18874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013157	A	6	6	18973	18978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013157	CAA	2	6	18980	18985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013157	A	7	7	18984	18990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013157	A	7	7	18995	19001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013157	CAA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013157	A	7	7	19015	19021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013157	TAT	3	9	19052	19060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013157	TAT	2	6	19068	19073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013157	T	6	6	19101	19106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013157	TGTT	2	8	20283	20290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013157	A	7	7	20353	20359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013157	TAAA	2	8	20360	20367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.